哈尔滨东火车站

三棵树站

1934年，三棵树站正式建成并投入使用。

1935年滨江站和哈尔滨站间通车，由于三棵树站与哈尔滨站间，与绥化间均通车，车站客货业务量大幅增加，站内线路由最初的11条增加到22条。

1938年至1939年，三棵树站与香坊站间通车，在两站间建成东门站，三棵树站与东门站间由单线增设复线。

1943年，三棵树站与太平桥站间修建三线。

1952年底，三棵树站划归哈尔滨铁路分局。

1956年，三棵树站开始进行大规模升级改造，于1957年完工。

1972年，三棵树站站场改造增设第26道。

1987年，车站进行了站场改造，在原候车室南侧新建了5000平方米的候车大厅，原候车大厅改建为售票厅，新建一座钢筋混凝土跨线天桥。

哈尔滨东站

1991年10月1日，三棵树站改名为哈尔滨东站。

2002年，车站装修了候车大厅和站台，并新建了售票厅和行包办理处，增设了电子显示屏。

2013年9月26日，哈尔滨地铁1号线开通，从哈尔滨东站站发出第一班地铁。

2015年6月，哈尔滨东站由独立一等站扩大管辖权，变更为站管站模式，由哈尔滨东站负责管理香坊站、滨江站、新香坊站、东门站，增加管辖集装箱中心站、内陆港和若干物流中心，整个改革在2015年12月最终完成。

2016年3月5日至2016年10月30日，哈尔滨东站进行了改扩建，拆除原有站台、进出站天桥，新建高架候车室、标准高站台和两座地下通道，增设直梯3部、上下行扶梯9部。

2017年6月30日，滨洲电气化改造工程中配套建设的哈尔滨东站电气化改造调试完毕投入使用，车站增加电力机车换挂业务。

2019年8月2日，哈尔滨东站不再作为独立车站存在于中国铁路车站名册，由哈尔滨车务段管辖。