主要在大小、软硬程度、制作成分、味道上的区别。啵啵的个头要比珍珠要大些，且质地上啵啵会比较软糯，而珍珠则会稍微硬一些。珍珠主要是由木薯制成的，所以会带着清淡的木薯味，而啵啵则是一种以魔芋为原料，配上果葡糖浆，糖和水制成的，可以有多种口味。
啵啵因体型比较大，又被称作为波霸。
啵啵和珍珠广泛应用于奶茶和甜品中，可以使口感更丰富。
啵啵常见的味道有原味，樱花味和黑糖味，吃起来Q弹脆爽。
