“五一”黄金周客运，是南京地铁开通试运营以来首次遇到，为了做到安全、准点、快捷、舒适，南京地铁运营部门编制了“五一”客运方案，将每天的运营时间延长到了23：00，尽最大努力满足乘客出行的需要。据南京地铁运营分公司有关负责人介绍，5月1日客流将近28万人次，全线高峰时段每小时进出站约5万人次，客流极为密集。后面几天客流保持在20多万人次/日，尽管客流比平时骤增，但地铁运营部门可以说是轻松应对。一方面是运营准备充足，在高峰时段投入14列车运行，设计行车间隔约6分钟，而乘客实际候车时间平均只有3分钟，这样的运力已足够满足客流的需要。另一方面，经过8个多月的试运行，广大市民熟悉乘车程序，知道了如何购票、进闸、上车、出站等流程。由于乘客对地铁的熟知与配合，从而减少了不必要的麻烦，大大提高了购票、进闸的使用率。尽管有部分外地乘客，但地铁安排了工作人员、志愿者进行了适当的引导，出行也较为顺畅。另外，节日期间，地铁车辆、售检票系统、空调等设备设施的完好运行，广大乘客倍感地铁的便捷、舒适。
