9月7日，秋高气爽，南京玄武湖、红山动物园、莫愁湖、栖霞山、古林公园、燕子矶等六大市属园林，免费向市民开放一天，公园汹涌的客流一大早就给南京地铁带来了巨大的考验，南京地铁运营部门积极应对突发大客流，安全、有序运送乘客42.18万人次。
早上8:00左右，各站陆续发现大批进站的乘客购票前往玄武门站和红山动物园站，中华门站和安德门站特别突出，排队进站购票的乘客将站前广场围个水泄不通，而此时红山动物园出站人数已经是平时的13倍。车站立即将此客流情况汇报控制中心及站务中心。随后的客流有增无减，面对突发的大客流，控制中心启动《突发大客流应急预案》 中华门开始售卖纸票，玄武门站、红山站打开边门对客流进行分流，持单程票、纸票的乘客一律从边门出站，单程票人工回收，持IC卡的乘客从出站闸机口刷卡出站。10点开始红山站进站客流开始形成，车站开启4个应急票亭在广场售卖纸票，并在引导乘客从1号口进站，2号口出站，形成的单方向循环，避免客流交叉。
该日全线客流总量高达421773人，而红山站更是创下纪录，进站人数达到近4万人是平时的4倍多，全线共售出纸票12143张，其中红山站售出11291张。受大客流影响最大的三个站点是中华门站、玄武门站、红山动物园站，这3个站共增设了十多个纸票临时销售点，尤其是红山动物园站，仅有4台自动售票机、4个进站闸机通道、2个通往动物园的出入口接待4万的进站客流和5万的出站客流，非常吃力。此外还从迈皋桥存车线抽调了一辆备用列车投入正线运营，大概到下午四点左右，红山动物园客流才开始回落。 由于应对及时，人员到位，全线没有出现大批乘客滞留及客伤情况。
