7月6日夜及7月7日上午，南京地区出现强降水过程，电闪雷鸣，南京市气象台发出暴雨橙色预警信号。大雨造成市区多条道路、小区积水严重，严重影响市民的出行。受强降水影响，南京地铁一号线沿线部分车站内出现不同程度的漏水现象，但对正常运营未造成影响，7日当天安全开行331列次，运送乘客28.7万人次。受暴雨影响的主要是元通站3号口变形缝严重漏水、珠江路站3号口残梯电梯井被雨水倒灌，以及新街口站5号口出入口处边墙也出现较大面积淌水。对此，运营分公司高度重视，7日上午9：00，运营分公司负责同志带领物设部、工务中心、机自中心等人员赶赴现场，先后到元通、新街口及珠江路三站进行了抢修，及时控制住现场情况，使得强降水对运营带来的不利影响降到最低。
